Buscan secuenciar el genoma de un nematodo que afecta al ajo

Estos patogenos microscopicos ocasionan, a nivel mundial, perdidas agricolas millonarias, indico Alejandra Rougon, investigadora de la ENES Leon de la UNAM

El nematodo propuesto para investigacion tiene muchos hospederos y uno de los principales es el ajo durante sus diferentes etapas. FOTO: UNAM.

Ademas de las plagas, bacterias, hongos y virus que afectan a los cultivos en general, tambien debe prestarse atencion a los nematodos fitoparasitos, conocidos como gusanos redondos, capaces de ocasionar perdidas agricolas millonarias.

Su principal medio de control es el uso extensivo de nematicidas; sin embargo, estos compuestos no solo son caros, sino altamente toxicos y peligrosos para el ambiente, indico Alejandra Rougon Cardoso, investigadora de la Escuela Nacional de Estudios Superiores (ENES) Unidad Leon, quien dirige un proyecto de investigacion enfocado a estudios genomicos y funcionales en un nematodo fitopatogeno de importancia agricola.

El proyecto, financiado por el Consejo Nacional de Ciencia y Tecnologia (Conacyt), esta encaminado a descifrar la secuencia del genoma de un nematodo del genero Ditylenchus, del que existe poca informacion, por lo que la doctora y su grupo pretenden generarla y, sobre todo, conocer mas con respecto al proceso de infeccion a fin de encontrar posibles genes blanco para su control en el ajo.

En colaboracion con una institucion de investigacion polaca, que cuenta con cepas europeas que los especialistas de la ENES pretenden secuenciar al tiempo de hacerlo con cepas mexicanas, haran comparaciones y buscaran predecir los genes que se encuentran en su genoma para determinar la funcion de aquellos que actuan en el proceso de patogenesis.

El nematodo propuesto tiene muchos hospederos y uno de los principales es el ajo durante sus diferentes etapas; “incluso desde el momento en que se siembra, el diente ya puede estar infectado por este organismo o permanecer en el suelo y material vegetal por mucho tiempo –hasta 10 años– en una especie de dormancia y desecacion, hasta encontrar un medio propicio para crecer de nuevo”, explico Rougon.

Este parasito representa un riesgo latente en el pais, en particular en Baja California, Sonora, Chihuahua, Sinaloa, Zacatecas, Nuevo Leon, Chiapas, Campeche, Quintana Roo y Guanajuato, donde hay grandes extensiones agricolas de posibles hospederos del nematodo, tanto de ajo como de cebolla, avena, papa, maiz y alfalfa, “cuya produccion sobrepasa los 119 millones de pesos al año”.

Si este organismo llegara a establecerse en esas zonas, podria devastar areas de plantios, sobre todo de ajo, hortaliza que se siembra en 25 estados del pais. Tan solo en 2013 en Mexico se produjeron mas de 59 mil toneladas.

El nematodo propuesto por la universitaria, integrante del Sistema Nacional de Investigadores, es una especie regulada por la Organizacion Europea y Mediterranea de Proteccion de Plantas, entidad intergubernamental que considera bajo control a este parasito, al igual que en nuestro pais, por lo que si se detecta, las restricciones comerciales son fuertes y obligan a eliminar la produccion, lo que implica grandes perdidas economicas.

La presencia de organismos regulados en ocasiones es subestimada, por lo que la magnitud de los posibles daños no es prevista, resalto.

En los ultimos años se han prohibido los nematicidas mas eficientes por el peligro que representan, lo que ha provocado una reemergencia de problemas en los cultivos, causados por nematodos parasitos. Por ello, “urgen nuevas medidas de control para nematodos fitopatogenos; una manera de identificar nuevas estrategias de control es por medio de los estudios genomicos y la de genes expresados durante la interaccion con la planta hospedera”, abundo.

La especialista en analisis de datos masivos de secuencias genomicas comento que estos estudios se realizan a traves de analisis bioinformaticos en equipo de computo de alto desempeño, con el que cuenta la ENES Leon, y la supercomputadora Miztli de la UNAM.

Este proyecto se inserta en la licenciatura de Ciencias Agrogenomicas, de reciente apertura en ese campus universitario, en la que se combinan las areas de las ciencias agricolas y las genomicas, vinculo de relevancia en la formacion de profesionales capaces de identificar y resolver problemas en el sector y, al mismo tiempo, proteger el medio ambiente.

“Queremos impulsar el Laboratorio de Ciencias Agrogenomicas como lider en investigaciones genomicas de importancia agricola en el pais”, concluyo la investigadora.

universidadagricola.com

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