Genoma del tomate, decodificado

El genoma del tomate (Solanum lycopersicum) ha sido decodificado por primera vez. Esto es un paso gigante hacia el mejoramiento de rendimientos, nutricion, resistencia a enfermedades, sabor, y color del tomate y otros cultivos. El genoma fue secuenciado especificamente del tomate Heinz 1706.  La secuencia completa del genoma asi como la secuencia de una variedad silvestre emparentada han sido publicadas en el numero mas reciente del diario Nature.

El diario Nature publica años de investigaciones conducidas por miembros del Consorcio para la Genomica del Tomate, una colaboracion internacional entre Argentina, Belgica, China, Francia, Alemania, India, Israel, Italia, Japon, Paises Bajos, Corea del Sur, España, Reino Unido, y Estados Unidos entre otros.

James Giovannoni, un cientifico del Instituto para la Investigacion de Plantas, Boyce Thompson y del Departamento de Agricultura Estadounidense (USDA) dirige el equipo de secuenciacion de tomate, el cual integra investigadores de varios institutos. La secuencia del genoma del tomate silvestre fue desarrollada en el laboratorio de Cold Spring Harbor.

Investigadores del consorcio reportan que el tomate posee unos 35,000 genes organizados en 12 cromosomas. Para cualquier caracteristica del tomate, ya sea sabor, resistencia a plagas inherente, o valor nutricional, hemos capturado practicamente todos esos genes,  subraya Giovannoni.

La secuencia de estos genes y su arreglo en los cromosomas se describe en el articulo del diario Nature La secuencia del genoma del tomate proporciona mas informacion sobre la evolucion de frutas pulposas,  cuya informacion permite a los investigadores un avance mas rapido, y a los fitomejoradores producir nuevas variedades con caracteristicas especificas deseables.

La genetica del tomate ofrece el potencial para obtener frutos con mejor sabor requerido por productores y consumidores. La secuencia genetica ayudara a resolver esto, y otros problemas con la calidad y produccion de tomates.  ” James Giovannoni, Boyce Thompson.

Ahora que la secuencia del genoma de una sola variedad ha sido descubierta, sera mucho mas facil y menos costoso para semilleras y fitomejoradores secuenciar otras variedades para investigacion y desarrollo, agrega Giovannoni. Mientras la primera secuencia del genoma costo un millon dolares, las subsiguientes podrian costar alrededor de solo $10,000 o menos, con base en estos resultados iniciales.

Para proporcionar acceso a las secuencias del genoma del tomate y a especies relacionadas, el cientifico Lukas Mueller del Boyce Thompson junto con su equipo han creado un sitio web interactivo (www.solgenomics.net). En Estados Unidos cientificos de Boyce Thompson, Zhangjun Fei y Joyce Van Eck contribuyeron a la secuencia y su analisis.

La secuencia del genoma del tomate tiene implicaciones para otras especies de plantas. Fresas, manzanas, melones, platanos, y muchas otras frutas pulposas comparten algunas caracteristicas con tomates, asi que informacion sobre los genes y las vias relativas a la maduracion de frutos podria aplicadarse a dichas especies, contribuyendo a mejorar la calidad y seguridad de los alimentos, asi como a bajar costos.

Ahora, podemos empezar a hacer preguntas interesantes sobre biologia de frutas, resistencia de enfermedades, desarrollo de las raices y calidad de nutricion, afirma Giovannoni. Los tomates representan, solo en Estados Unidos, un mercado de $2,000 millones de dolares.

La secuencia no habria sido posible sin el trabajo de Steven Tanksley y Greg Martin de Boyce Thompson en los ™90. Tanksley, Martin, y otros cientificos desarrollaron mapas geneticos y otras herramientas moleculares para tomates con objeto de estudiar los mecanismos de resistencia a enfermedades, y al final esas herramientas allanaron el camino para los esfuerzos de secuenciar el genoma.

universidadagricola.com

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